Cơ cấu và tổ chức của Viện bao gồm:

– Hội đồng quản lý Viện;

– Ban lãnh đạo Viện gồm có Viện trưởng và các Phó Viện trưởng;

– Các phòng nghiên cứu và phòng chức năng, bao gồm: Văn phòng; Phòng nghiên cứu phát triển các công cụ đánh giá; Phòng Tuyển sinh đào tạo; Phòng tổ chức đánh giá công nhận kết quả; Phòng Tài chính, kế toán; ngoài ra, tùy theo nhiệm vụ của Viện để thành lập các phòng, các trung tâm, đơn vị phụ thuộc.

– Các chi nhánh, văn phòng đại diện của Viện tại các tỉnh, thành phố trong và ngoài nước theo quy định của pháp luật và Hiệp hội.

– Các phòng chức năng và đơn vị trực thuộc không có pháp nhân riêng.